Comportamento dos estimadores de metilação e hidroximetilação de DNA na presença de correlação
PDF (Português (Brasil))

Keywords

Metilação de DNA
Hidroximetilação de DNA
Máxima verossimilhança

How to Cite

SILVA, Nicole; KIIHL, Samara. Comportamento dos estimadores de metilação e hidroximetilação de DNA na presença de correlação. Revista dos Trabalhos de Iniciação Científica da UNICAMP, Campinas, SP, n. 27, p. 1–1, 2019. DOI: 10.20396/revpibic2720192452. Disponível em: https://econtents.bc.unicamp.br/eventos/index.php/pibic/article/view/2452. Acesso em: 18 may. 2024.

Abstract

Recentemente, além dos estudos de perfis de metilação de DNA na associação de câncer e demais doenças, tem sido crescente o interesse em perfis de hidroximetilação de DNA. Diferentes métodos foram desenvolvidos para permitir que metilação e hidroximetilação possam ser medidos simultaneamente, mas a metodologia estatística para resumir esses dados e produzir estimadores consistentes para a proporção de metilação/hidroximetilação em um dado sítio ainda não se consolidou. Dessa forma, o objetivo principal deste trabalho é estudar o comportamento dos estimadores das proporções de citosinas metiladas (5-mC) e citosinas hidroximetiladas (5-hmC) na presença de correlação nos dados provenientes dos diferentes métodos de conversão de DNA frequentemente utilizados (BS, oxBS e TAB).

https://doi.org/10.20396/revpibic2720192452
PDF (Português (Brasil))

References

KIIHL, Samara F. et al. MLML2R: an R package for maximum likelihood estimation of DNA methylation and hydroxymethylation proportions. Statistical applications in genetics and molecular biology, v. 18, n. 1, 2019.
MARIANI, Christopher et al. Alterations of 5-hydroxymethylcytosine in human cancers. Cancers, v. 5, n. 3, p. 786-814, 2013.
QU, Jianghan et al. MLML: consistent simultaneous estimates of DNA methylation and hydroxymethylation. Bioinformatics, v. 29, n. 20, p. 2645-2646, 2013.
TAHILIANI, Mamta et al. Conversion of 5-methylcytosine to 5-hydroxymethylcytosine in mammalian DNA by MLL partner TET1. Science, v. 324, n. 5929, p. 930-935, 2009.

Todos os trabalhos são de acesso livre, sendo que a detenção dos direitos concedidos aos trabalhos são de propriedade da Revista dos Trabalhos de Iniciação Científica da UNICAMP.

Downloads

Download data is not yet available.